Пакетиране на ДНК
В ДНК се кодира информация за нашите гени - около 60 000 в човешкия геном. Молекулата на ДНК е доста дълга и трябва да се пакетира плътно в 22 хромозоми в соматичните клетки и 22 хромозоми и една Х или една Y-хромозома в гаметите. Пакетирането започва чрез навиване на ДНК около октамер от хистони. След това се формира структура "мъниста на нишка", като от нея се образува нуклеозома и хроматинова нишка - разширена и кондендирана - формира се хроматин. Най-накрая ДНК се пакетира в хромозомите и се съхранява в ядрото на клетките, където може да бъде защитена от случайно накъсване и увреда. Пакетирането на ДНК наподобява плетене на една кука - със всяка бримка, конецът се скъсява, като плетката се сгъстява и се оформя исканата от нас форма (Вж. Фигурата - Пакетиране на ДНК).
ДНК се навива около хистоните и след това постепенно се пакетира в хроматин и хромозоми. Подобен принцип се изпозва при плетенето, където с всяка бримка и оплитане, плетката се сгъстява и придобива исканата от нас форма. (Модифицирана от фигура на Kevin J Verstrepen)
Пет обзорни статии за сиртуини
2.
Shouji Matsushima and Junichi Sadoshima. The role of sirtuins in cardiac disease. Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2015 Nov; 309(9): H1375–H1389. doi: 10.1152/ajpheart.00053.2015
3.
Nicolas Preyat and Oberdan Leo. Sirtuin deacylases: a molecular link between metabolism and immunity. J Leukoc Biol. 2013 May;93(5):669-80. doi: 10.1189/jlb.1112557
4.
Wioleta Kupis, Jan Pałyga, Ewa Tomal, and Ewa Niewiadomska. The role of sirtuins in cellular homeostasis. J Physiol Biochem. 2016; 72: 371–380. doi: 10.1007/s13105-016-0492-6
5.
Adrianna Z Herskovits and Leonard Guarente. Sirtuin deacetylases in neurodegenerative diseases of aging. Cell Res. 2013 Jun; 23(6): 746–758. doi: 10.1038/cr.2013.70
Какво представляват сиртуините?
Сиртуините са NAD+ (никотинамид аденин динуклеотид)-зависими ензими - деацетилази, които премахват ацетилни групи от клетъчни протеини и променят тяхната функция. Деацетилират се протеини в цитоплазмата, където се регулира клетъчния метаболизъм или/и в ядрото, където регулира експресията на гени. В ядрото има няколко фини механизма на контрол за:
-
опаковане на ДНК около протеини наречени хистони,
-
свързване на транкрипционни фактори към определени ДНК последователности
-
метилиране на нуклеотида цитозин по протежение на ДНК молекулата
Установява се, че хистоните пакетират добре ДНК и "умълчават" гени – те един вид затварят кутията с информация. Когато хистоните се ацетилират (от ензими наречени ацетилази - HAT) кутията се отваря – опаковането, не е така плътно и транскрипционните фактори имат достъп до определени ДНК последователности в промотори на гени, чиято експресия се регулира. При външни сигнали ацетилните групи могат да се премахнат от деацетилази и „отворените” гени отново да се умълчат. На практика много гени се умълчават и експресират едновременно като се наблюдават разнообразни модификации в хистоните и различна степен на ДНК метилиране, които взаимно се допълват.
Това показва, че процесите са динамични и осигуряват фин контрол чрез специфичен епигенетичния код (модификации в хистони, метилиране на ДНК и образуване на ремоделиращи комплекси от транскрипционни фактори). Този код се създава от ензими, които добавят химични групи - наречени writers; ензими, които премахват тези групи – еrasors; фактори, наречени readers, които прочитат епигенетичните маркери (Фигура 1).
Сиртуините са вид HDAC (хистон деацетилази), зависими от NAD+, които при човек са 7 типа и са локализирани в различни части на клетката (Фигура 2). Освен деацетилазна активност, те имат и други ензимни активности за:
-
регулация на клетъчния метаболизъм
-
функциониране на митохондриите
-
регулация на възпалението
-
поправка на увредена ДНК
Те улавят промени в окислително-редукционните реакции и анаболитно-катаболитните процеси. Крайният резултат от активирането им е поддържане на баланс във физиологичните процеси, което увеличава резистеността към заболявания и забавя стареенето (Фигура 3).
Епигенетичните модификатори са writers - поставят епигенетични маркери, erasers - премахват маркери, readers - идентифицират маркери. Ac-ацетилиране, TF-транскрипционни фактори (HAT-хистон ацетилази, HDACs-хистони деацетилази), SIRTs-сиртуини, TF-транскрипционни фактори, Ac-ацетилиране). Фигурата е изработена от Петя Димитрова с BioRender.
Сиртуините са 7 типа и могат да се покализират в различни места в клетката. Фигурата е изработена от Петя Димитрова с CorelDraw.
Сиртуините повишават резистенността към стрес, подобряват регенеративния потенциал и намаляват възпалението (NAD-никотинамид аденин диннуклеотид, AMPK-ацетил-КоА карбоксилазна киназа). Фигурата е изработена от Петя Димитрова с CorelDraw.